Veleszületett elhízási panel: szekvenálás és CNV elemzés

Állapot leírása

A veleszületett elhízás a zsír túlzott felhalmozódása és tárolása a testben, amely csecsemőkorban és/vagy gyermekkorban van jelen. Az elhízás diagnosztizálható elszigetelt klinikai leletként vagy a szindrómás leletek részeként. A gyermekkori elhízás monogén formái nagyon ritkák. Csak néhány, az étvágyat és az anyagcserét szabályozó gén mutációi okozzák a súlyos elhízás kialakulását kisgyermekkorban. Az EGL teszteket kínál a veleszületett elhízás szindrómás és nem szindrómás egygénes okaira vonatkozóan; a hajlam és a fogékonyság génjei nem szerepelnek ebben a tesztelésben.

gyermekkori elhízás

A veleszületett és korán megjelenő elhízás szindrómás okai ezen a panelen a következők:

  • Albright örökletes osteodystrophia
  • Alstrom szindróma
  • Bardet-Biedl szindróma
  • Borjeson-Forssman-Lehmann szindróma
  • Cohen-szindróma
  • Schaaf-Yang szindróma (más néven Prader-Willi-szerű szindróma)
  • Leptinhiány
  • Leptin receptor hiány
  • MC4R (melanocortin 4 receptor) hiány

  1. Farooqi, I. Sadaf és Stephen O'Rahilly. "Genetikai elhízás szindróma". Az elhízás genetikája. Írta: Struan F. A. Grant. New York: Spinger, 2014. 23-32. Nyomtatás.
  2. Goldstone AP, Beales PL. Genetikai elhízás szindrómák. A hormonok kutatásának határai. 2008. 36: 37-60. doi: 10.1159/0000115336.
  3. Funcke J és mtsai. A gyermekkori elhízás monogén formái a leptin gén mutációi miatt. Mol Cell Pediatr. 2014. december; 1: 3.
  4. McLennan Y és mtsai. Törékeny X szindróma. Jelenlegi genomika. 2011 május; 12 (3): 216-224.
  5. A GeneReviews elérhető: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1116/.
  6. Az OrphaNet elérhető a http://www.orpha.net/ címen.

Gének (29)

Jelzések

A teszt a következőkre javallt:

  • A veleszületett elhízás klinikai vagy feltételezett diagnózisával rendelkező egyének.

Módszertan

Új generációs szekvencia: Az összes kódoló exon oldatban történő hibridizációját a páciens genomi DNS-jén végezzük. Bár néhány mély intronikus régiót is elemezhetünk, ez a vizsgálat nem azt jelenti, hogy a legtöbb promóter régiót, mély intronikus régiókat vagy más szabályozó elemeket kikérdezze, és nem észleli az egy vagy több exonból álló deléciókat vagy duplikációkat. A befogott régiók közvetlen szekvenálását a következő generációs szekvenálás segítségével hajtjuk végre. Ezután a beteg génszekvenciáit összehasonlítjuk egy standard referenciaszekvenciával. A potenciálisan ok-okozati variánsok és az alacsony lefedettségű területek Sanger-szekvenáltak. A szekvencia variációkat patogénnek, valószínűleg patogénnek, jóindulatúnak, valószínűleg jóindulatúnak vagy ismeretlen jelentőségű változatnak minősítik. Az ismeretlen jelentőségű változatok további vizsgálatokat tehetnek szükségessé a beteg és/vagy a családtagok részéről.

Másolatszám-elemzés: Ezen a panelen a gének megcélzott régióinak NGS-olvasási mélységét (lefedettségét) összehasonlító elemzést végeztük a kópiaszám-variánsok (CNV) kimutatására. A detektált variánsok pontossága nagymértékben függ az esemény méretétől, a szekvencia kontextustól és a megcélzott régióhoz kapott lefedettségtől. Ezen változók és korlátozások miatt a minimális validált CNV-méret nem határozható meg; azonban az egyetlen exon deléciója és duplikációja várhatóan alatta marad az elemzés kimutatási határának.

Érzékelés

Új generációs szekvencia: Klinikai érzékenység: ismeretlen. A promóter régió mutációi, az intronok egyes mutációi és más szabályozó elem mutációk nem mutathatók ki ezzel az elemzéssel. A molekuláris elemzés eredményeit a beteg klinikai/biokémiai fenotípusának összefüggésében kell értelmezni.

Analitikai érzékenység a szekvenciaváltozatok kimutatására:

Másolatszám-elemzés: Ennek a módszernek az érzékenysége és specifitása a CNV kimutatására nagymértékben függ az esemény nagyságától, a szekvencia kontextustól és az érintett régió lefedettségének mélységétől. A vizsgálat nagyon érzékeny az 500 bázispárt meghaladó vagy legalább 3 exont tartalmazó CNV-kre. Kisebb (